Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Xrcc3Q9CXE6 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
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Xrcc3Q9CXE6 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Xrcc3Q9CXE6 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Xrcc3Q9CXE6 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
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Xrcc3Q9CXE6 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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