Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CWU4 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CWU4 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CWU4 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CWU4 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CWU4 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CWU4 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CWU4 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms