Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms