Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Gm43066-201ENSMUST00000199589 1260 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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