Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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