Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms