Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms