Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPU1

Ssxb1, MCG116417, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb1Q9CPU1 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ssxb1Q9CPU1 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
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Ssxb1Q9CPU1 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ssxb1Q9CPU1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ssxb1Q9CPU1 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ssxb1Q9CPU1 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ssxb1Q9CPU1 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssxb1Q9CPU1 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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