Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms