Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms