Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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TrabdQ99JY4 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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TrabdQ99JY4 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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TrabdQ99JY4 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
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TrabdQ99JY4 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
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TrabdQ99JY4 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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TrabdQ99JY4 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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TrabdQ99JY4 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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TrabdQ99JY4 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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TrabdQ99JY4 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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TrabdQ99JY4 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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TrabdQ99JY4 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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TrabdQ99JY4 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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TrabdQ99JY4 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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