Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Apobec3Q99J72 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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