Protein–RNA interactions for Protein: Q99J38

Ttc30a1, Tetratricopeptide repeat protein 30A1, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc30a1Q99J38 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc30a1Q99J38 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc30a1Q99J38 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc30a1Q99J38 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc30a1Q99J38 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc30a1Q99J38 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc30a1Q99J38 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc30a1Q99J38 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc30a1Q99J38 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc30a1Q99J38 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc30a1Q99J38 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc30a1Q99J38 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc30a1Q99J38 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc30a1Q99J38 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc30a1Q99J38 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc30a1Q99J38 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc30a1Q99J38 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc30a1Q99J38 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc30a1Q99J38 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc30a1Q99J38 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc30a1Q99J38 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc30a1Q99J38 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc30a1Q99J38 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc30a1Q99J38 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc30a1Q99J38 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ttc30a1Q99J38 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms