Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
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Rnf144aQ925F3 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Rnf144aQ925F3 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Rnf144aQ925F3 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Rnf144aQ925F3 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Rnf144aQ925F3 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
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