Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms