Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Slc6a20aQ8VDB9 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Slc6a20aQ8VDB9 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Slc6a20aQ8VDB9 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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