Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scara5Q8K299 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
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