Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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