Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Brf1Q8CFK2 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Brf1Q8CFK2 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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