Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI2

Cdc34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc34Q8CFI2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms