Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAS9

Parp9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp9Q8CAS9 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp9Q8CAS9 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp9Q8CAS9 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp9Q8CAS9 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp9Q8CAS9 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp9Q8CAS9 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp9Q8CAS9 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp9Q8CAS9 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp9Q8CAS9 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp9Q8CAS9 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp9Q8CAS9 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp9Q8CAS9 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp9Q8CAS9 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp9Q8CAS9 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp9Q8CAS9 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp9Q8CAS9 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp9Q8CAS9 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp9Q8CAS9 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp9Q8CAS9 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp9Q8CAS9 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp9Q8CAS9 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp9Q8CAS9 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp9Q8CAS9 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp9Q8CAS9 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp9Q8CAS9 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp9Q8CAS9 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp9Q8CAS9 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp9Q8CAS9 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp9Q8CAS9 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp9Q8CAS9 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp9Q8CAS9 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp9Q8CAS9 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp9Q8CAS9 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp9Q8CAS9 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp9Q8CAS9 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp9Q8CAS9 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp9Q8CAS9 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp9Q8CAS9 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp9Q8CAS9 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp9Q8CAS9 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp9Q8CAS9 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp9Q8CAS9 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Parp9Q8CAS9 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Parp9Q8CAS9 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Parp9Q8CAS9 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Parp9Q8CAS9 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp9Q8CAS9 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp9Q8CAS9 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp9Q8CAS9 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp9Q8CAS9 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp9Q8CAS9 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp9Q8CAS9 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp9Q8CAS9 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp9Q8CAS9 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp9Q8CAS9 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp9Q8CAS9 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp9Q8CAS9 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp9Q8CAS9 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp9Q8CAS9 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp9Q8CAS9 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp9Q8CAS9 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp9Q8CAS9 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp9Q8CAS9 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp9Q8CAS9 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp9Q8CAS9 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp9Q8CAS9 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp9Q8CAS9 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp9Q8CAS9 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp9Q8CAS9 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp9Q8CAS9 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp9Q8CAS9 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp9Q8CAS9 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp9Q8CAS9 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp9Q8CAS9 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp9Q8CAS9 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp9Q8CAS9 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp9Q8CAS9 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp9Q8CAS9 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp9Q8CAS9 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Parp9Q8CAS9 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Parp9Q8CAS9 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Parp9Q8CAS9 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Parp9Q8CAS9 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Parp9Q8CAS9 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Parp9Q8CAS9 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Parp9Q8CAS9 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Parp9Q8CAS9 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Parp9Q8CAS9 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Parp9Q8CAS9 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Parp9Q8CAS9 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Parp9Q8CAS9 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Parp9Q8CAS9 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Parp9Q8CAS9 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Parp9Q8CAS9 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Parp9Q8CAS9 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Parp9Q8CAS9 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Parp9Q8CAS9 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Parp9Q8CAS9 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Parp9Q8CAS9 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Parp9Q8CAS9 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms