Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms