Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0L9

Gpcpd1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpcpd1Q8C0L9 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpcpd1Q8C0L9 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms