Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kdm4aQ8BW72 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kdm4aQ8BW72 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kdm4aQ8BW72 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kdm4aQ8BW72 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Kdm4aQ8BW72 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Kdm4aQ8BW72 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Kdm4aQ8BW72 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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