Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms