Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BGC1 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BGC1 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BGC1 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BGC1 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BGC1 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BGC1 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BGC1 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8BGC1 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8BGC1 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms