Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms