Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ttc28Q80XJ3 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ttc28Q80XJ3 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Ttc28Q80XJ3 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Ttc28Q80XJ3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Ttc28Q80XJ3 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Ttc28Q80XJ3 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Ttc28Q80XJ3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
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