Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SnupnQ80W37 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms