Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ube3cQ80U95 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3cQ80U95 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3cQ80U95 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3cQ80U95 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3cQ80U95 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3cQ80U95 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3cQ80U95 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3cQ80U95 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3cQ80U95 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3cQ80U95 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3cQ80U95 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3cQ80U95 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3cQ80U95 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3cQ80U95 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3cQ80U95 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3cQ80U95 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3cQ80U95 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3cQ80U95 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3cQ80U95 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3cQ80U95 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3cQ80U95 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3cQ80U95 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3cQ80U95 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube3cQ80U95 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3cQ80U95 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3cQ80U95 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3cQ80U95 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3cQ80U95 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3cQ80U95 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3cQ80U95 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3cQ80U95 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3cQ80U95 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3cQ80U95 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3cQ80U95 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3cQ80U95 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3cQ80U95 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3cQ80U95 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3cQ80U95 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3cQ80U95 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3cQ80U95 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3cQ80U95 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3cQ80U95 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3cQ80U95 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3cQ80U95 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3cQ80U95 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3cQ80U95 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3cQ80U95 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3cQ80U95 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3cQ80U95 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3cQ80U95 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3cQ80U95 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3cQ80U95 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3cQ80U95 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3cQ80U95 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube3cQ80U95 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube3cQ80U95 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube3cQ80U95 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube3cQ80U95 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube3cQ80U95 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms