Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snd1Q78PY7 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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