Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms