Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme8Q715T0 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 161.3 ms