Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ino80Q6ZPV2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms