Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFD9

Nup98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup98Q6PFD9 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup98Q6PFD9 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms