Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SvoplQ6PDF3 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms