Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sohlh1Q6IUP1 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms