Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt39Q6IFX4 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms