Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZL1

Fgd6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd6Q69ZL1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fgd6Q69ZL1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms