Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pkp4Q68FH0 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Pkp4Q68FH0 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Pkp4Q68FH0 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Pkp4Q68FH0 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Pkp4Q68FH0 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pkp4Q68FH0 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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