Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sall3Q62255 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.1 ms