Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

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Length 993 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sycp1Q62209 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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