Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

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Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Slc6a4Q60857 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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