Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Traf3Q60803 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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Traf3Q60803 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Traf3Q60803 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Traf3Q60803 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Traf3Q60803 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Traf3Q60803 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Traf3Q60803 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Traf3Q60803 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Traf3Q60803 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Traf3Q60803 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Traf3Q60803 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms