Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSH7

Zzef1, Zinc finger ZZ-type and EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,924 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zzef1Q5SSH7 Gm3283-201ENSMUST00000199319 1350 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Zzef1Q5SSH7 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms