Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ccdc85aQ5SP85 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ccdc85aQ5SP85 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ccdc85aQ5SP85 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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