Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

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Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Spire1Q52KF3 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Spire1Q52KF3 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Spire1Q52KF3 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Spire1Q52KF3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Spire1Q52KF3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Spire1Q52KF3 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Spire1Q52KF3 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Spire1Q52KF3 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Spire1Q52KF3 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Spire1Q52KF3 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Spire1Q52KF3 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Spire1Q52KF3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Spire1Q52KF3 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Spire1Q52KF3 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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