Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrfip1Q3UZ39 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrfip1Q3UZ39 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrfip1Q3UZ39 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrfip1Q3UZ39 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrfip1Q3UZ39 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrfip1Q3UZ39 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrfip1Q3UZ39 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrfip1Q3UZ39 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrfip1Q3UZ39 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrfip1Q3UZ39 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrfip1Q3UZ39 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrfip1Q3UZ39 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrfip1Q3UZ39 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrfip1Q3UZ39 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrfip1Q3UZ39 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms