Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPW2

Elf3, ETS-related transcription factor Elf-3, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elf3Q3UPW2 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Elf3Q3UPW2 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms