Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULA2

Btrc, F-box/WD repeat-containing protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 605 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BtrcQ3ULA2 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BtrcQ3ULA2 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms